前一陣子有個新的 project, 需從人類的軟組織中 extract genomic DNA, 而且, 檢體數還不少, 大約有三四百個檢體要做.
一下子來了這麼多檢體, 這時候人類想走捷徑的偷懶, 喔不, 是講求效率的天性又發揮了, 最後, 終於找到不貴又方便 , 又不會有檢體間污染的好工具, 那就是進行組織研磨的 ceramic bead.
在這裡, 我推薦兩個好用的牌子:
第一個就是大家耳熟能詳的 Roche, 產品名為 MagNA Lyser Green Beads.
圖片出自這裡
每一管中裝的是直徑為1.4mm的陶瓷珠, 藉由震盪來磨碎其中的組織. 而震盪的力道則是來自於搭配使用的 MagNA Lyser Instrument.
圖片出自這裡
根據不同組織的特性, 如:軟硬度或是結締組織的多寡,調整震盪的速度與時間.
它的優點是陶瓷珠已分別裝於每一獨立的管中, 使用超級方便, 對於 RNA 的萃取也是一項不錯的選擇. 缺點就是, 當步驟精簡越多, 所需付出的成本也越大, 幫需要進行的檢體量很大時, 就要稍微計算一下花費了.
第二個要介紹的是 Precellys Beads Kit.
圖片出自這裡
它們家其實有著各式大小以及不同材質的珠子以供不同研磨需求的使用者選擇.
不過由於使用 MagNA Lyser Green Beads在先, 因此我還是以 1.4mm ceramic bead來做實驗.
與 MagNA Lyser Green Beads相較, Precellys Beads感覺質地比較硬. 以 MagNA Lyser Green Beads研磨後珠子的碎屑比較多, 所以用 Precellys Beads來研磨時, 研磨時間可減少約5秒, 震盪速度也可減少 500rmp左右.
Precellys Beads 有個很大的優點在於包裝選擇比較多, 除了已填裝好的外, 也有散裝可以買, 只要另外自備適當的旋蓋管, 就可以自行填入陶瓷珠, 價錢上也會迷人很多.
另外, 先前提過它有多種不同大小材質, 自己可以依照實驗檢體的特性, 將不同珠子自由搭配, 讓研磨效果達到完美.
Precellys 也有研磨機, 不過我沒有用過.
圖片出自這裡
如要利用 ceramic beads 來進行核酸萃取, 一開始會需要花一些時間找到最佳的研磨轉速與時間, 特別是脆弱的 RNA, 而且每一種組織最好都先測試看看. 雖然會花一些功夫, 但條件試出來後, 接下來就是快樂的 High-Throughput Extraction.
7月 06, 2009
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